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浙江省政协副主席浙江省科技厅副厅长浙江大学医学院附属邵逸夫医院院长美国罗玛琳达大学医学中心、浙江大学医学院邵逸夫医院联合腔镜诊治中心主任；中国抗癌协会胰腺癌专业委员会委员中华医学会外科分会肝脏外科学组委员、中华医学会浙江分会器官移植学会委员、医院管理学会委员、浙江省抗癌协会肝胆胰肿瘤专业委员会副主任委员;《中国微创外科杂志》、《浙江临床医学杂志》、《全科医学临床与教育杂志》副主编，《中国实用外科杂志》常务编委，《中华医学杂志》、《中华创伤杂志》《中华急诊医学杂志》等二十多本杂志编委。蔡秀军教授在他近20年的从医生涯中，以高尚的医德、精湛的医术及无私的奉献精神赢得众多病人及同道们的称赞。在长期的临床一线工作中，他积累了丰富的第一手资料，在腹部外科和腔镜外科方面有着丰富的经验和造诣。开展了背驮式肝移植，高难度的肝脏尾状叶、肝门胆管癌切除术，完成了国内病例数最多的腹腔镜肝脏切除术，达到国际领先技术水平。他除了完成繁忙的临床工作外，还承担多项重大科研项目。至今已获得国家技术发明二等奖一项，国家科技进步二等奖一项，浙江省科技进步一等奖二项。发表学术论文70多篇;主编、参编的著作10余部。曾获浙江省第四届青少年英才奖、1999年浙江省青年科技奖、中国普通外科杰出中青年学者称号，入选2002、2004年浙江省151人才工程， 是浙江省优秀医生、浙江省优秀青年教师， 2003年被评为浙江省有突出贡献的中青年科技人才，2002年度获国务院特殊津贴。2007年获何梁何利科学与技术创新奖。

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