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2006年至2015年，学校科研经费达38亿元，获得国家及部省级科技成果奖100余项，其中作为第一完成单位获得国家科技进步一等奖1项、二等奖7项、技术发明奖二等奖3项。学校凭借雄厚的科研实力，主动服务社会、服务“三农”，创造了巨大的经济社会效益，多次被评为国家科教兴农先进单位。 截至2014年9月，学校被ESI收录论文5242篇，被引用36011次。 2013年度主要科技成果获奖情况一览表 序号 成果名称 获奖类别及等级 授奖部门 第一完成人 1 冷却肉品质控制关键技术及装备创新与应用 国家科学技术进步奖二等奖 国务院 周光宏 2 梨高光效树形及花果管理技术研发与应用 高等学校科学研究优秀成果奖技术发明奖一等奖 教育部 张绍铃 3 有机肥作用机制和产业化关键技术研究与推广 高等学校科学研究优秀成果奖科学技术进步奖、一等奖 教育部 沈其荣 4 农田固碳减排研究及应用 高等学校科学研究优秀成果奖科学技术进步奖、二等奖 教育部 潘根兴 5 中国农田温室气体排放与减排增汇研究 江苏省科学技术奖一等奖 江苏省人民政府 黄耀 6 梅种质资源研究与创新利用 江苏省科学技术奖三等奖 江苏省人民政府 房经贵 7 棉纤维发育的基因组学与分子育种研究团队 中华农业科技奖优秀创新团队 农业部中国农学会 张天真 8 苏淮猪新品种培育与推广应用 中华农业科技奖科学研究成果二等奖 农业部中国农学会 王林云 9 小四轮拖拉机与农用运输车常见故障诊断排除图解 中华农业科技奖科普奖 农业部中国农学会 鲁植雄 10 克氏螯虾营养需求研究及人工配合饲料的研发与应用 江苏省海洋与渔业科技创新奖三等奖 江苏省海洋与渔业科技创新奖奖励工作办公室 刘文斌 11 长江下游农区多花黑麦草高产栽培及利用技术的基础研究 中国草业科技奖二等奖 中国草学会 沈益新 12 梨生殖生理与分子生物学研究团队 华耐园艺科技奖 中国园艺学会等 张绍铃 13 中国工业化、城镇化进程中的农村土地问题研究 第六届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）一等奖 教育部 曲福田 图书馆藏 根据2015年3月图书馆网站显示，学校图书馆有藏书208万册，电子图书65万册，电子西文期刊12000种，电子中文期刊16200种。 学术期刊 《南京农业大学学报（社会科学版）》《南京农业大学学报（社会科学版）》于2001年创刊，是南京农业大学主办的学术性理论刊物，现为双月刊。该刊入选CSSCI来源期刊、全国中文核心期刊、国家社科基金资助期刊、教育部名栏工程入选期刊、人大复印资料重要转载来源期刊。 《南京农业大学学报》《南京农业大学学报》为全国中文核心期刊。该刊已被美国《化学文摘》（CA）、英国《国际农业与生物技术文摘》（CABI）、美国《剑桥科学文摘（自然科学）》（CSA）、英国《动物学记录》（ZR）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ）、波兰《哥白尼索引》（IC）、日本科学技术振兴机构文献数据库（JST）收录；该刊还呗《中文核心期刊要目总览》(2013年版)、中国科学引文数据库（核心库）（CSCD）、中国科技论文统计源期刊（CJCR）（中国科技核心期刊）、中国科技期刊精品数据库、《中国学术期刊评价研究报告》（RCCSE）核心期刊、中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中国期刊全文数据库（CJFD）、中国科学引文索引（CSCI）、《中国学术期刊文摘》（英文版）、《中国生物学文摘》等收录。 《中国农业教育》《中国农业教育》杂志是教育部主管、南京农业大学主办的一份国内外公开发行的国家级综合性农业教育刊物，创刊于1992年。 该刊是《中国学术期刊（光盘版）》、《中国期刊网全文数据库》及《中文科技期刊数据库》来源期刊。 《畜牧与兽医》《畜牧与兽医》是由中国已故著名学者罗清生教授等老一辈科学家于1935年创刊，建国后王栋教授等于1950年复刊，是我国第一本国内外公开发行的畜牧、兽医类综合性科技期刊。现由教育部主管、南京农业大学主办。该刊设有“试验研究”、“畜牧生产”、 “兽医科技”、“疾病防治”、“专题论述”、“文献综述”、“畜牧兽医简报”等6个固定栏目，以及“动物保护”、“专家论坛”等几个不定期栏目。
《南京农业大学学报》为综合性农业学术期刊，1956年创刊，包括《南京农业大学学报》（自然科学版）和《南京农业大学学报》（社会科学版），主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、文献综述、研究简报。《南京农业大学学报》为中文核心期刊、中国精品科技期刊、百种中国杰出学术期刊、中国科学引文数据库(CSCD)源期刊、中国科技期刊引证报告(CJCR)源期刊，12013年的影响因子为221，2014年各项学术指标综合排名在1989种统计源期刊中排第250位。
农业与生命科学版 扬州大学学报：中南林业科技大学学报） 竹子研究汇刊 中国森林病虫 林业资源管理 浙江林业科技 林业实用技术 S8 畜牧、动物医学：中国草地学报） 草地学报 动物营养学报 蚕业科学 黑龙江畜牧兽医 草业科学 中国家禽 动物医学进展 中国饲料 畜牧与兽医 饲料工业 中国畜牧杂志 饲料研究 中国畜牧兽医 S9 水产：中国兽医科学） 中国兽医杂志 草业学报 中国草地（改名为：环境昆虫学报） 植物检疫 中国植保导刊 S6 园艺类核心期刊表 园艺学报 果树学报 中国蔬菜 北方园艺 食用菌学报 中国果树 中国食用菌 中国南方果树 S7 林业类核心期刊表 林业科学 林业科学研究 北京林业大学学报 福建林学院学报 东北林业大学学报 南京林业大学学报、蚕、蜂类核心期刊表 畜牧兽医学报 中国兽医学报 中国预防兽医学报 中国兽医科技（改名为 自然科学版 浙江林学院学报 西北林学院学报 世界林业研究 中南林学院学报（改名为、狩猎 自然科学版 浙江大学学报、农作物类核心期刊表 作物学报 中国水稻科学 麦类作物学报 玉米科学 杂交水稻 棉花学报 中国油料作物学报 大豆科学 种子 核农学报 农业生物技术学报 中国棉花 作物杂志 植物遗传资源学报 中国烟草科学 S4 植物保护类核心期刊表 植物病理学报 中国生物防治 植物保护学报 植物保护 农药 农药学学报 昆虫天敌（改名为 农业与生命科学版 湖南农业大学学报 华南农业大学学报 河北农业大学学报 西南农业学报 江西农业大学学报 河南农业大学学报 吉林农业大学学报 安徽农业科学 上海农业学报 中国农业学报 沈阳农业大学学报 西北农业学报 四川农业大学学报 安徽农业大学学报 江苏农业科学 江苏农业学报 云南农业大学学报 山东农业大学学报，S5农学：中国土壤与肥料） 生态环境 中国水土保持 中国生态农业学报 S2 农业工程类核心期刊表 农业工程学报 灌溉排水学报 农业机械学报 节水灌溉 中国农村水利水电 干旱地区农业研究 农机化研究 中国农机化 S 自然科学版 广东农业科学 甘肃农业大学学报 湖北农业科学 新疆农业科学 广西农业生物科学 东北农业大学学报 贵州农业科学 河南农业科学 新疆农业大学学报 S1 农业基础科学类核心期刊表 土壤学报 水土保持学报 土壤 土壤通报 植物营养与肥料学报 水土保持通报 水土保持研究 土壤肥料（改名为 自然科学版 浙江农业学报 内蒙古农业大学学报 自然科学版 华中农业大学学报 中国农业大学学报 福建农林大学学报S 综合性农业科学类核心期刊表 中国农业科学 南京农业大学学报 华北农学报 西北农林科技大学学报
《南京农业大学学报》属于综合性农业科学核心期刊。
根据武汉大学发表的《中国学术期刊评价的做法及结果》文章查询，属于A+级核心期刊
《南京农业大学学报》为综合性农业学术期刊，1956年创刊，包括《南京农业大学学报》（自然科学版）和《南京农业大学学报》（社会科学版），主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、文献综述、研究简报。《南京农业大学学报》为中文核心期刊、中国精品科技期刊、百种中国杰出学术期刊、中国科学引文数据库(CSCD)源期刊、中国科技期刊引证报告(CJCR)源期刊，12013年的影响因子为221，2014年各项学术指标综合排名在1989种统计源期刊中排第250位。
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《南京农业大学学报》在线采编系统从2011年11月1日起试运行。采用在线采编系统，可实现作者在线投稿、查稿，专家在线审稿，编辑在线办公。该系统具有快捷、互动、方便的优点，有利于信息及时交流。 由于在线采编系统为试运行，网站暂时由开发采编系统的公司进行服务器托管，所以校内作者投稿和专家审稿要通过网关登录到校外。网址：。 欢迎广大读者、作者和科研人员使用，并将使用过程发现的问题以及需要改进的意见及时反馈给学报编辑部。编辑部电话：025–84395214，或者发送电子邮件到。《南京农业大学学报》编辑部2011 年 11月1日
《南京农业大学学报》为综合性农业学术期刊，1956年创刊，包括《南京农业大学学报》（自然科学版）和《南京农业大学学报》（社会科学版），主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、文献综述、研究简报。《南京农业大学学报》为中文核心期刊、中国精品科技期刊、百种中国杰出学术期刊、中国科学引文数据库(CSCD)源期刊、中国科技期刊引证报告(CJCR)源期刊，12013年的影响因子为221，2014年各项学术指标综合排名在1989种统计源期刊中排第250位。
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《南京农业大学学报》还是比较好发的。
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核心级的期刊。可以发表副高、高级职称的文章。只要文章质量度、内容都符合刊物要求，发表起来应该会比较顺利。
《南京农业大学学报》为综合性农业学术期刊，1956年创刊，包括《南京农业大学学报》（自然科学版）和《南京农业大学学报》（社会科学版），主要刊登农业科学、植物保护、园艺科学、动物科学、动物医学、生物技术与工程、资源与环境科学、农业工程等学科具有创新性的研究论文、文献综述、研究简报。《南京农业大学学报》为中文核心期刊、中国精品科技期刊、百种中国杰出学术期刊、中国科学引文数据库(CSCD)源期刊、中国科技期刊引证报告(CJCR)源期刊，12013年的影响因子为221，2014年各项学术指标综合排名在1989种统计源期刊中排第250位。