杂志社有权对论文进行修改

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没事，文章都是你写的，你就是著作权人，你可能觉得，杂志社出版了你的文章，可能对你的文章享有版权，但是根据 《中华人民共和国著作权法》第五十六条 本法所称的著作权即版权。其实你才是权利人。

不可以修改。发到知网上的论文不可更改，不可逆。如果说实在严重的话，可以像所发期刊提出修改申请，之后由所发期刊杂志社向知网提出申请。申请审核通过后再提交文章进行二次审核，但是此时涉及一个二次发表以及重复率问题，

很遗憾，不能。但是你修改一下，让人觉得两篇文章没关联，那就没问题，或者在深度上有区别，也没问题。有些期刊你在同意发表时候会签署相应条款，可能你没仔细看，有的期刊会要求编辑可以对你的文章进行适当改动，