同一篇文章被两个杂志社发表了会怎么样吗

对于毕业当然是没有任何问题的。学校不会管的。如果后做以后研究工作的话，再投稿时会有影响，你这两篇文章的审稿专家如果以后再遇到你的文章，就比较难发了，成黑名单了。因为你这是一稿多投，

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如果这篇文章是在本单位的内部刊物上发表的，那内部刊物可能没有双刊号，即使有可能也不和中国知网、万方数据库等检索网站合作，所以应该不会影响你文章的复制率或者学术价值，

同一篇论文是不能同时投往不同的杂志的，你可以看看你所投期刊的投稿要求，肯定会说明这一条，因为这会有违版权协议。但事已至此，你只能选择一家你认为有较高影响力的发表刊登，而委婉拒绝另一家杂志社。

主动的做法：告诉其中一家，论文不发了。被动的做法：杂志社通知你交版面费，你别交就是了。