硕士论文在查重时去掉文献综述会不会增加重复率，这个要看学校会不会对文献综述进行查重，如果不查这部分内容的重复率，去不去掉都一样，如果要查的话，去掉了肯定会影响查重结果的，可能会导致重复率变低。医学类论文，综述部分通常是要放在论文中进行查重的。如果是非医学类论文，文献综述部分通常不需要查重。但是具体情况需要看学校的要求，按照学校的要求即可。或者咨询研究生院、学院研究生秘书等等。通常情况下，硕士毕业论文需要提交：目录、摘要（中文、英文）、正文、致谢、参考文献。医学类研究生论文需要放入综述，其他专业视学校要求而定。封面、独创声明、版权声明，不影响查重结果。
