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截至2014年6月，该校建有2个省级重点实验室 ，刘少奇研究所、牡丹江红色文化研究所、资本论方法研究所、新型功能材料研究所、澳大利亚研究中心等研究机构 。省级重点实验室：凝聚态物理重点实验室、新型碳基功能超硬材料重点实验室 馆藏资源 据2014年7月学校图书馆官网显示，牡丹江师范学院图书馆藏书总量50万册，有纸质中、外文期刊3000多种。另外还拥有中国知网、中国科技期刊数据库、外文期刊数据库等中外文数据库13个，有电子图书63万册。 学术刊物 《牡丹江师范学院学报》（哲学社会科学版）是由黑龙江省教育厅主管、牡丹江师范学院主办、国内外公开发行的综合性学术期刊（双月刊）。国际标准刊号：ISSN 1003—6121，国内统一刊号：CN 23—1082/C。设有政治理论、哲学、经济学、历史、语言文学、教育、东北地方史研究、中共党史研究、中国古代文学研究、教育理论研究等主要栏目，并适时增加新的栏目。《牡丹江师范学院学报》（自然科学版）是由黑龙江省教育厅主管、牡丹江师范学院主办、国内外公开发行的综合性学术期刊（季刊）。国际标准刊号：ISSN 1003—6180，国内统一刊号：CN 23—1289/N。主要栏目有：数学、 物理、 化学、 生命科学、黑龙江省农林研究、 地理科学、 计算机理论及应用、体育理论研究、教育理论研究等栏目。学报于2006年先后加入“中国学术期刊（光盘版）”、“中国期刊网”全文数据库、“万方—数字化刊群”和“中文科技期刊数据库”，在学术界的影响不断扩大，并获首届全国优秀社科学报整体设计奖 。

牡丹江大学学报的投稿须知： 论点明确，论据可靠，数字准确，文字精练，纯文字稿件控制在 5000 字以内，含图表稿件控制在 4 版以内，题目不要超过 20 个字。有各种立项课题的论文应在来稿中注明（包括项目编号）。作者应在论文标题下标明工作单位全称、所在城市及邮政编码。并在文后附上作者简介（姓名、出生年、性别、籍贯、职称、学位以及研究方向）、联系电话、邮寄地址、 E-mail 地址。 论文应有摘要和关键词。摘要属报道性文摘， 200 字左右，内容包括研究的目的、方法、结果和结论等。关键词是能反映论文主题概念的词或词组，每篇论文标注 3 ～ 5 个。 外文、符号、数码要求工整清晰，对容易混淆的字母、符号，应标明文种、大小写、正斜体，属上下角标的字母、数码和符号其位置高低应区别明显，在表达量值时单位一律使用国际符号，用正体。 插图应有图号、图名；表格应采用三线表，且有表序和表名。 参考文献须在文中作标引，并按在文中出现的次序依次编排。常用的几种文献书写格式如下：[1] 专著：主要责任者 文献题名 [M] 译者 出版地：出版者，出版年 起止页码 [2] 期刊：主要责任者 文献题名 [J] 刊名（外文可缩写），年，（期）：起止页码 [3] 报纸文章：主要责任者 文献题名 [N] 报纸名 , 出版日期（版次） [4] 电子文献：主要责任者 电子文献题名 [ 电子文献类型标识 / 载体类型标识 ] 电子文献的出处或可获得地址，发表或更新日期 / 引用日期 参考文献类型标识码：专著 [M] ，论文集 [C] ，报纸文章 [N] ，期刊文章 [J] ，学位论文 [D] ，研究报告 [R] ，标准 [S] 。电子参考文献类型标识：数据库 [DB] ，计算机程序 [CP] ，电子公告 [EB] 。电子文献载体类型标识：磁带 [MT] ，磁盘 [DK] ，联机网络 [OL] ，如网上电子公告标识为 [EB/OL] ，联机网上数据库标识为 [DB/OL] 。