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健康时报72%的读者皆为自费订阅。目前，健康时报与全国32家省级邮政局都有着紧密的合作，并在全国300多个大中城市皆有零售，其中在北京的上摊率达到99%以上，在上海的上摊率达到93%以上。为让读者能在更快的时间内看到健康时报，健康时报在北京、重庆、广州、杭州、常州、西安、济南、太原、兰州等10个城市同步印刷。健康时报期均发行量在全国健康类报纸中名列前茅，其主要发行渠道为： 除社会订阅外，健康时报开展了特定渠道的订阅宣传：▲中央、国务院各部委、名军兵种四大部、等80余个离退休老干部局，1000余家全国干休所近10万老干部常年订阅。▲全国300多家三甲医院的院长、药房主任定向订阅；▲中华医学会及各分会400余位副主任委员以上专家定向订阅本报；▲全国近10000家药店发放、展示。▲全国300多家三甲医院科普教育专栏及1000家社区医院院长、主任定向订阅。▲北京、上海、杭州等近10000个社区阅报栏张挂。▲中国南方航空、中国东方航空、海南航空、上海航空等将健康时报选为机舱读物，在上百条国内、国际航线传阅。

已被收录在美国的化学文摘（CA），国际农业生物科学中心（CABI），中心农业生物科学摘要（CABA），美国剑桥科学文摘（CSA）和波兰的哥白尼（IC）当中，在国内是中国的科学技术核心期刊，为中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊，并收录于中国核心期刊数据库（遴选），中国科学技术期刊数据库，中国生物学文摘和中国电子期刊服务，影响因子逐年增加。