发酵技术的核心研究对象包括

生物技术的内容主要包括：（1）基因工程；（2）细胞工程；（3）发酵工程；（4）酶工程；（5）蛋白质工程。其中基因工程技术是核心技术。细胞工程是在细胞水平上的技术，主要是以动物细胞和植物细胞为对象，微生物的细胞操作另立到发酵工程中去研究。蛋白质工程要以基因工程为基础，通过对基因的人工定向改造来创造新型蛋白质的技术，所以又称第二代基因工程。

分别包括育种、最适发酵条件、分离提纯技术。关系是相互渗透。从广义上讲，发酵工程由三部分组成，是上游工程，中游工程和下游工程。其中上游工程包括优良种株的选育，最适发酵条件（pH、温度、溶氧和营养组成）的确定，营养物的准备等。中游工程主要指在最适发酵条件下，发酵罐中大量培养细胞和生产代谢产物的工程技术。这里要有严格的无菌生长环境，包括发酵开始前采用高温高压对发酵原料和发酵罐以及各种连接管道进行灭菌的技术。下游工程指从发酵液中分离和纯化产品的技术，包括固液分离技术（离心分离，过滤分离，沉淀分离等工艺），细胞破壁技术。